Como não tenho entrado neste forum vai a sugestão com atraso de quase um mês.
Para atualizar, veja no manual da placa ou no link abaixo. É bem simples e só não pode ter Win8. Com o Win7 dá pra fazer. Depois de atualizar roda também no Win8.
http://mcuoneclipse.com/2014/11/01/illu ... -firmware/Isto se você não detonou o bootloader. Sim há como detonar. Aí só com a ferramenta da P&E (que eu saiba).
Para selecionar sua ferramenta de debug, não é ao criar o projeto e sim após criar o projeto pode selecionar a ferramenta para este projeto.
No KDS, vá no ícone do inseto(debug), clique na seta para expandir e clique em "config Configurations". Lá você seleciona o seu debugador preferido, no caso o (OpenSDA) . Há outros e também pode instalar outros.
Quanto a bug, não tive problemas mas não tenho uso intensivo no KDS.
Se sua placa for muito antiga (REV A por exemplo), tem que corrigir bugs de hardware. Veja a versão de sua placa. A mais nova é a REV E (não tem bugs de hardware).
Outro detalhe, tem que ter o KDS 3.0 com o KSDK (kinetis SDK) versão mais nova instalada. Aí tem essa placa (FRDM-KL25) selecionar ao criar o projeto.